Het is het jaar 2046. De mensheid heeft de planeet Mars gekoloniseerd. In een onderzoeksinstituut van de Union Aerospace Corporation rent een groep wetenschappers voor hun leven. Een voor een worden ze gegrepen door een voor de kijker onzichtbaar monster. Alleen Dr. Carmack ontsnapt naar een afgesloten kamer, en zend een SOS bericht uit. Nauwelijks is hij klaar, of de deur wordt opengebroken door het monster.
Op aarde wordt een groep van acht mariniers opgetrommeld door Sarge om gehoor te geven aan de noodoproep. Het onderzoeksinstituut is inmiddels afgesloten, en de 79 medewerkers die er nog zitten mogen niet terugkeren naar de aarde. Terwijl de groep zich klaarmaakt, neemt Sarge een van de mannen, John "Reaper" Grimm, ter zijde. Hij vraagt hem niet mee te gaan omdat zijn zus een van de mensen in het instituut is. Reaper slaat dit verzoek af. Het team reist af naar mars via een teleportatie-apparaat genaamd de Ark, welke zich bevind in Area 51. De Ark werd in 2026 ontdekt, en al 20 jaar proberen wetenschappers te achterhalen wie het gebouwd heeft en waarom. Bij aankomst op Mars ontmoet de groep Pinky, een man die door een ongeluk met de Ark zijn onderlichaam is kwijtgeraakt. Tevens ontmoeten ze Reaper’s zus, Dr. Samantha, die hen inlicht over de situatie.
Het team heeft de opdracht om het gevaar dat in het instituut schuilt te elimineren. John praat met zijn zus en hoort van haar dat men humanoïde restanten heeft gevonden op Mars. Deze restanten hebben een 24e chromosoom, wat deze wezens supersterk maakt en onkwetsbaar voor ziektes. De mariniers doorzoeken de basis, en vinden Dr. Carmack. Hij is in shock en kan niet praten. Wanneer de mariniers het instituut verder doorzoeken, komen ze oog in oog te staan met monsterlijke wezens. Het team leid een paar verliezen, maar kan ook enkele van de monsters doden.
Door onderzoek naar het stoffelijk overschot van een van de monsters ontdekt de groep dat deze monsters wellicht ooit mensen waren, die door het 24e chromosoom zijn veranderd in monsters. Volgens Dr. Grimm is dit chromosoom onderdeel van de nog onbekende 10% van het menselijk genoom, en codeert het voor een gen dat bepaalt of iemand slecht is of niet. De mariniers ontdekken ook dat Dr. Carmack dit chromosoom heeft toegedient bij een gevangene genaamd Curtis Stahl, waarna deze uitbrak. Hij heeft vervolgens meerdere mensen geïnfecteerd.
Na een reeks gevechten met de monsters blijven alleen Sarge, Reaper, The Kid, Duke en Dr. Grimm over. Ze ontdekken dat een monster genaamd "The Baron" (mogelijk de bron van alle monsters) is ontsnapt naar de aarde via de Ark. Voordat de groep hem achterna reist, neemt Sarge nog een wapen genaamd de “BFG” (Big Fucking Gun) mee.
Terug op aarde ontdekt het team dat de UAC-faciliteit vol ligt met lichamen. Sarge beveelt de groep om alle overlevenden alsnog te doden om te voorkomen dat het virus zich verder verspreid. Enkele van de slachtoffers zijn al veranderd in zombies. The Kid en Duke komen om in een gevecht met deze zombies. Reaper wordt dodelijk getroffen door een kogel. Om hem te redden dient Dr. Grimm hem het 24e chromosoom toe. De gok pakt goed uit, en in plaats van hem in een monster te veranderen geeft het chromosoom Reaper juist bovenmenselijke vaardigheden.
|
